На основе лингвистического анализа было абсолютно точно доказано, что примерно на стыке III и IV веков нашей эры (то есть после смерти Иосифа Флавия) оригиналы рукописей были отредактированы. Редакторами могли быть или Ориген, или Евсевий, жившие как раз в это время.
Причина редактирования - Иосиф Флавий нигде не говорил об Иисусе, что с точки зрения отцов христианской церкви было немыслимо. Поэтому они заставили правоверного иудея назвать Иисуса Мессией, причем допустили очень серьзную ошибку - настоящий Иосиф Флавий обязательно назвал бы Мессию Машиахом (ивритский и арамейский термины), не не Христосом (греческий термин).